Questão:
Lise de células bacterianas - que solução usar?
slimsuwan
2012-12-12 20:03:05 UTC
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Estou tentando determinar a rapidez com que os detergentes agem nas células bacterianas (lise celular). Eu gostaria de comparar alguns detergentes em concentrações diferentes para atividade bacteriolítica. Eu não me importo com todos os metabólitos dentro das células (proteínas, DNA, etc ...). Muitas publicações sugerem que soluções mais complicadas são usadas. Meu primeiro pensamento foi usar um detergente simples preparado em PBS ou solução salina para a lise das células. Preciso de uma solução complexa para lisar as células? Alguém poderia me dar uma sugestão? Desde já, obrigado.

Dois respostas:
user560
2012-12-12 20:37:23 UTC
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Qual é exatamente o propósito de lisar as células? As soluções "complicadas", como você diz, incluem um monte de ingredientes. O detergente está amplamente presente para dissolver as membranas celulares (que são baseadas em lipídios) e permitir a extração de proteínas ou outros compostos bioquímicos de dentro da célula (e organelas nos eucariotos). Existem também dois tipos de detergentes: iônicos e aniônicos. Ambos os tipos de detergente dissolvem as membranas, mas os detergentes iônicos tendem a ser mais severos dos dois, pois desorganizam fortemente as estruturas das proteínas.

Se a bioquímica das proteínas é importante, os próximos ingredientes mais importantes serão inibidores específicos de proteases: enzimas que degradam proteínas. Existem muitos deles, mas alguns exemplos incluem PMSF, EDTA, aprotinina, etc.

Às vezes, é necessário tamponar o pH da solução de lise para monitorar complexos de proteínas, ou manter a natureza de uma proteína, ou manter o DNA em uma faixa de pH ideal. Soluções gerais para tampões de lise incluem Tris-EDTA (TE), PBS, etc. Essa escolha se resume a se você deseja um tampão e em qual faixa de pH deseja manter sua solução de lise. Tampões comuns como TE e PBS são feitos para uma faixa de pH entre 7-8. Existem outros tampões que são usados ​​para faixas de pH baixas (pH 4-6), mas geralmente são menos comuns.

Por último, existem maneiras de lisar células sem usar qualquer tipo de tampão de lise. Um método é usar sonicação, que usa pulsos direcionados de som de alta frequência para lisar as células, cortando-as mecanicamente. Outro método é congelar-descongelar repetidamente as células de -80 ° C a 4 ° C (geralmente 3 vezes é suficiente). A lise dessa maneira é realizada pela formação repetida de cristais de gelo que cortam as células abertas, liberando seu conteúdo.

Se você tiver uma pergunta mais específica, um de nós pode orientá-lo mais, mas isso fornece uma visão geral do que está envolvido com os buffers de lise celular.

Alan Boyd
2012-12-12 21:35:42 UTC
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Eu me pergunto como você planeja medir a lise. Você encontrará muitos métodos de lise para E. coli incorporam um tratamento com lisozima e EDTA. Isso ocorre para que as camadas de lipopolissacarídeo (membrana externa) e de peptidoglicano do envelope celular possam ser rompidas antes que o detergente (geralmente SDS ou Triton X-100) seja adicionado para dissolver a membrana interna ou citoplasmática. Suspeito que se você adicionar detergente às células intactas, não seria particularmente eficaz, e quaisquer células afetadas permaneceriam como células desnaturadas que, por exemplo, ainda contribuiriam para a densidade óptica. geralmente são capazes de resistir aos sais biliares no intestino delgado, as bactérias Gram-negativas podem ser bastante resistentes aos detergentes. Por exemplo, muitas Enterobacteriaciae podem crescer em 5% SDS - ver:

Rajagopal, S et al . (2003) Oito bactérias Gram-negativas são 10.000 vezes mais sensíveis aos detergentes catiônicos do que aos detergentes aniônicos. Canadá. J. Mic. 49: 775-779



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